空間分析正以全新的視角揭示那些曾被忽視的生命奧秘--從細胞分布、微環(huán)境互作、關(guān)鍵調(diào)控機制到空間生物標志物。2025 年 8 月 26 日，10x Genomics 空間峰會將于上海舉辦，本次會議主題《開辟空間生物學新航道 ? 遇見未知 探索新徑》，特邀腫瘤學、免疫學和神經(jīng)科學等多領(lǐng)域?qū)＜?，分享前沿突破性成果，同時帶來 10x Genomics 最新 Visium 與 Xenium 空間平臺進展，助力空間生物學研究全面升級。

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會議嘉賓及參會議程

亮點內(nèi)容搶先看

前沿研究者將帶來最新研究成果及重要發(fā)現(xiàn)，從食管癌進化圖譜的繪制、三級淋巴結(jié)構(gòu)對免疫應(yīng)答的調(diào)控，到乳腺癌 ADC 藥物療效的預(yù)測，充分展示空間組學在解析復雜生命活動和精準醫(yī)學研究中的重要作用和應(yīng)用潛力。

曾博蘇州系統(tǒng)醫(yī)學研究所 研究員

1. Cancer Cell：利用空間轉(zhuǎn)錄組，繪制首個食管癌發(fā)生發(fā)展的單細胞多階段空間進化圖譜

癌癥的發(fā)生發(fā)展涉及腫瘤細胞及其周圍微環(huán)境的共同進化，然而目前對組織空間結(jié)構(gòu)中它們相互作用的動態(tài)變化仍不清楚。2025 年 3 月 10 日，中國醫(yī)學科學院聯(lián)合團隊在Cancer Cell發(fā)表重要研究 Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis，研究者對 43 名患者的 127 個多階段組織樣本進行單細胞空間轉(zhuǎn)錄組分析，繪制出人類食管鱗狀細胞癌（ESCC）的進化軌跡。通過 640 萬個細胞分析，發(fā)現(xiàn) ESCC 進展由一群增殖性上皮細胞亞群驅(qū)動，并驅(qū)動癌癥相關(guān)成纖維細胞（CAFs）的招募和轉(zhuǎn)化，最終形成 CAF-Epi（CAF 和上皮細胞）生態(tài)小室，促進腫瘤細胞免疫逃逸。為鱗狀細胞癌治療和患者預(yù)后評估提供關(guān)鍵靶點和指標。

講座亮點：

（1）首次從單細胞、空間維度系統(tǒng)性揭示了人類食管鱗狀細胞癌（ESCC）的進化軌跡

（2）揭示了 JAG1–NOTCH1 信號軸的空間激活模式，驅(qū)動 CAF–Epi 生態(tài)位的形成，以促進腫瘤免疫逃逸

（3）建立「CAF-Epi-Immune」評分體系，成功將機制發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為臨床預(yù)測指標

孫云帆肝膽腫瘤與肝移植外科副主任醫(yī)師、復旦大學附屬中山醫(yī)院

2. 整合多組學揭示長期生存者中三級淋巴結(jié)構(gòu)選擇壓力下的癌癥進化

研究基于多組學分析發(fā)現(xiàn)在 TLS 陽性腫瘤中，成熟型腫瘤內(nèi)淋巴樣結(jié)構(gòu)（TLS）能夠限制腫瘤基因組的進化，從而帶來長期生存獲益。TLS 內(nèi)富集了一類靜息態(tài)干樣 CD8? T 細胞，并為其提供支持性的腫瘤內(nèi)微環(huán)境；此外，區(qū)域性的 IgM–FcμR 相互作用進一步增強了這類干樣 CD8? T 細胞的抗腫瘤免疫效應(yīng)。

講座亮點：

（1）多組學發(fā)現(xiàn)腫瘤內(nèi)成熟型 TLS 限制腫瘤基因組進化，延長患者生存期

（2）靜息態(tài)干樣 CD8? T 細胞亞群在 TLS 陽性腫瘤中顯著富集

（3）TLS 為干樣 CD8? T 細胞提供支持性腫瘤內(nèi)微環(huán)境

（4）空間組學揭示局部 IgM–FcμR 相互作用增強干樣 CD8? T 細胞的抗腫瘤免疫效應(yīng)

馬丁復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院 副研究員

3. Cancer Cell：空間多組學結(jié)合 AI 模型，預(yù)測抗體偶聯(lián)藥物在乳腺癌輔助治療中的效果

在癌癥治療中，為下一代抗體偶聯(lián)藥物 （ADC） 選擇最佳候選藥物仍然具有挑戰(zhàn)性。2025 年 6 月 9 日，復旦大學研究團隊在Cancer Cell發(fā)表最新研究成果Spatial determinants of antibody-drug conjugate SHR-A1811 efficacy in neoadjuvant treatment for HER2-positive breast cancer，研究利用基因測序、計算病理學和單細胞原位空間成像，在臨床試驗中確定抗體偶聯(lián)藥 SHR-A1811 治療的 HER2 陽性乳腺癌患者的治療生物標志物。同時開發(fā)了一種 AI 預(yù)測模型，根據(jù)臨床特征和病理圖像預(yù)測其對偶聯(lián)藥物的治療反應(yīng)性。

講座亮點：

（1）基于空間成像，確定了對抗 HER2 抗體偶聯(lián)藥物（ADC）輔助治療反應(yīng)性的空間生物標志物

（2）結(jié)合 Xenium 技術(shù)與數(shù)字病理學揭示了這些空間生物標志物的作用機制

（3）基于空間生物標志物可實現(xiàn)乳腺癌的精準方案選擇

俞章盛上海交通大學生命科學技術(shù)學院、上海交通大學醫(yī)學院 教授

4. Nature Communication：HERGAST 揭示超大空間轉(zhuǎn)錄組切片中的精細空間結(jié)構(gòu)并增強基因表達信號

空間轉(zhuǎn)錄組學（ST）技術(shù)徹底改變了我們對組織內(nèi)基因表達組織的理解，為細胞異質(zhì)性和組織結(jié)構(gòu)提供了寶貴的見解。近年來，空間轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)正向高分辨率平臺過渡，如 Visium HD 和 Xenium。2025 年 4 月 28 日，上海交通大學研究團隊在Nature Communication發(fā)表最新研究 Unveiling fine-scale spatial structures and amplifying gene expression signals in ultra-large ST slices with HERGAST，提出一種用于超大規(guī)模和超高分辨率空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)中的空間結(jié)構(gòu)識別和信號放大的系統(tǒng) HERGAST，采用分割—迭代—征服（DIC）的分析計算架構(gòu)，用于克服現(xiàn)有空間組學計算方法的局限性，有效處理超大型空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)。為復雜空間組織和腫瘤異質(zhì)性解析提供依據(jù)。

講座亮點：

（1）分割–迭代–征服（DIC）框架實現(xiàn)了超大規(guī)模空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可擴展分析

（2）HERGAST 構(gòu)建了結(jié)合空間與基因表達特征的異質(zhì)圖譜

（3）HERGAST 可從噪聲較大的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中有效還原稀疏基因信號

而來自10x Genomics 專家將帶來Visium 與 Xenium 平臺的最新進展及未來規(guī)劃，與大家探討這些技術(shù)如何加速基礎(chǔ)研究與藥物研發(fā)的創(chuàng)新進程。

亮點提要：

1.Visium 平臺最新進展：如 Visium HD 3’，Visium HD Cell Segmentation 以及 Visium 平臺未來的研發(fā)計劃

2.Xenium 平臺最新進展：如 Xenium 高級定制 panel，Xenium RNA 及蛋白共檢測解決方案以及 Xenium 平臺未來的研發(fā)計劃

3. 空間組學技術(shù)的最新應(yīng)用以及空間組學技術(shù)如何加速藥物研發(fā)

內(nèi)容策劃：鄒禮平

內(nèi)容審核：朱卿

題圖來源：圖蟲創(chuàng)意