研究團(tuán)隊(duì)依托華大時(shí)空組學(xué)技術(shù) Stereo-seq 與多種單細(xì)胞組學(xué)測(cè)序技術(shù)，首次創(chuàng)建了完整解碼動(dòng)物發(fā)育過程的多模態(tài)數(shù)據(jù)集，繪制出果蠅全發(fā)育周期的 3D 單細(xì)胞時(shí)空多組學(xué)圖譜。這一里程碑式成果系統(tǒng)揭示了細(xì)胞類型分化的時(shí)空動(dòng)態(tài)和關(guān)鍵調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，為發(fā)育生物學(xué)、發(fā)育缺陷及相關(guān)疾病研究奠定了全新分子基礎(chǔ)。

時(shí)空組學(xué)技術(shù)持續(xù)攻堅(jiān)，多篇頂刊見證突破

越來越多的頂刊成果，正在用事實(shí)證明——華大時(shí)空組學(xué)技術(shù) Stereo-seq正在成為生命科學(xué)前沿突破的強(qiáng)勁引擎。為了進(jìn)一步幫助大家了解并應(yīng)用時(shí)空組學(xué)，8月6日14:00-15:30華大時(shí)空組學(xué)聯(lián)合百奧智匯舉行解密頂刊文章——時(shí)空組學(xué)驅(qū)動(dòng)精準(zhǔn)發(fā)現(xiàn)引擎直播課程，特邀南方科技大學(xué)副研究員胡琪楠、華大生命科學(xué)研究院生物信息副研究員張銀、北京百奧智匯科技有限公司技術(shù)支持甄彩鑫，從研究、應(yīng)用、實(shí)踐等角度為大家全面解析時(shí)空組學(xué)。

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課程內(nèi)容速覽

報(bào)告一

? 分享主題：?jiǎn)渭?xì)胞三維時(shí)空多組學(xué)解析果蠅組織發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控因子

? 分享嘉賓：南方科技大學(xué)副研究員胡琪楠

? 核心內(nèi)容：

? 構(gòu)建跨胚胎至蛹期的果蠅單細(xì)胞 3D 時(shí)空多組學(xué)圖譜 Flysta3D?v2，整合 Stereo?seq、scRNA?seq、scATAC?seq，獲得超 400 萬單細(xì)胞分辨率連續(xù)分子圖譜。

? 應(yīng)用 Spateo 框架實(shí)現(xiàn)多模態(tài)數(shù)據(jù)配準(zhǔn)、細(xì)胞命運(yùn)軌跡重建和全胚胎三維測(cè)量，追蹤神經(jīng)、中腸等組織發(fā)育動(dòng)態(tài)。

? 揭示中腸區(qū)域化建立時(shí)空模型，為組織穩(wěn)態(tài)和再生研究提供新范式。

? 繪制中腸細(xì)胞亞型分化路徑，發(fā)現(xiàn)銅細(xì)胞譜系特異性調(diào)控因子 exex，并通過功能驗(yàn)證證實(shí)其調(diào)控銅離子穩(wěn)態(tài)。

? 發(fā)布交互式數(shù)據(jù)庫(kù)和分析代碼，為果蠅發(fā)育及跨物種研究提供系統(tǒng)化資源。

報(bào)告二

? 分享主題：時(shí)空組學(xué)技術(shù)揭示疾病發(fā)病機(jī)制

? 分享嘉賓：華大生命科學(xué)研究院生物信息副研究員張銀

? 核心內(nèi)容：

? 時(shí)空組學(xué)技術(shù)揭示乳腺癌脈管微環(huán)境

Stereo?seq 技術(shù)解析 30 例乳腺癌與轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)，繪制高分辨率空間圖譜，首次發(fā)現(xiàn)小靜脈平滑肌細(xì)胞與 ACKR1? 內(nèi)皮細(xì)胞協(xié)同形成富趨化因子的微環(huán)境，關(guān)聯(lián)免疫浸潤(rùn)和臨床療效。

? 時(shí)空組學(xué)技術(shù)揭示爆發(fā)性心肌炎機(jī)制

單核與空間轉(zhuǎn)錄組分析 CVB3 誘導(dǎo)小鼠 FM，揭示間皮細(xì)胞作為早期關(guān)鍵靶點(diǎn)，引發(fā)炎癥級(jí)聯(lián)。發(fā)現(xiàn) Cd8? T 細(xì)胞及 IFN?γ / Spi1 軸是心肌細(xì)胞損傷關(guān)鍵路徑，IVIG 治療顯著改善預(yù)后，提示潛在治療靶點(diǎn)。

報(bào)告三

? 分享主題：理論×實(shí)踐：解鎖時(shí)空高分之道

? 分享嘉賓：北京百奧智匯科技有限公司技術(shù)支持甄彩鑫

? 核心內(nèi)容：

? Stereo?seq：500nm亞細(xì)胞級(jí)空間轉(zhuǎn)錄組，兼容新鮮冷凍和FFPE組織，芯片可定制，最大可支持13x13cm超大視野，滿足多種場(chǎng)景的臨床科研需求。

? Stereo-CITE：同時(shí)捕獲mRNA+蛋白組，解鎖更多維度信息，全面解析疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制。

? 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)分享：高質(zhì)量實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)分享，捕獲基因數(shù)、檢測(cè)靈敏度等性能全面提升，讓科研探索快人一步。