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圖文實(shí)操:GraphPad 的統(tǒng)計(jì)分析與圖表導(dǎo)出指南

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接上篇,我們介紹了如何在 GraphPad 中創(chuàng)建圖表。今天學(xué)霸菌主要講解它的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能及圖表的多種導(dǎo)出格式。


圖源:https://academic.oup.com/nar/article/49/8/4421/6225232?login=falsehttps://www.nature.com/articles/s41586-024-08532-4

一、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能

GraphPad Prism 提供了從基礎(chǔ)到高級(jí)的多種統(tǒng)計(jì)分析方法,以下是 GraphPad Prism 主要統(tǒng)計(jì)分析功能,大家可以根據(jù)數(shù)據(jù)類型和研究需求選擇合適的分析工具。

1

基礎(chǔ)統(tǒng)計(jì)分析:


正態(tài)性檢驗(yàn):通過 Shapiro-Wilk 檢驗(yàn)或 Kolmogorov-Smirnov 檢驗(yàn)判斷數(shù)據(jù)是否符合正態(tài)分布。

t 檢驗(yàn):包括獨(dú)立樣本 t 檢驗(yàn)、配對(duì)樣本 t 檢驗(yàn)和單樣本 t 檢驗(yàn),用于比較兩組數(shù)據(jù)的均值差異。

單因素方差分析(ANOVA):用于比較三組或以上數(shù)據(jù)的均值差異,支持多重比較校正(如 Tukey、Bonferroni 等方法)。

2

非線性回歸分析:


曲線擬合:支持多種非線性回歸模型(如指數(shù)增長、Logistic 曲線、Sigmoidal 曲線等),自動(dòng)計(jì)算擬合參數(shù)和 R2 值。

劑量反應(yīng)曲線:用于分析藥物劑量與生物效應(yīng)之間的關(guān)系,支持 IC50/EC50 計(jì)算。

3

生存分析:


Kaplan-Meier 曲線:用于分析生存數(shù)據(jù),支持 Log-rank 檢驗(yàn)比較組間差異。

Cox 比例風(fēng)險(xiǎn)模型:用于多因素生存分析。

4

相關(guān)性分析:


Pearson 相關(guān)性:用于分析連續(xù)變量之間的線性關(guān)系。

Spearman 相關(guān)性:用于分析非正態(tài)分布數(shù)據(jù)或等級(jí)數(shù)據(jù)的相關(guān)性。

5

高級(jí)統(tǒng)計(jì)分析:


主成分分析(PCA):用于降維和數(shù)據(jù)可視化。

聚類分析:支持層次聚類和 K-means 聚類。

時(shí)間序列分析:用于分析時(shí)間相關(guān)的數(shù)據(jù)趨勢(shì)。

6

自動(dòng)化分析:


一鍵分析:根據(jù)數(shù)據(jù)類型自動(dòng)推薦合適的統(tǒng)計(jì)方法,簡化分析流程。

批量分析:支持同時(shí)對(duì)多組數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,提高效率。

在導(dǎo)入數(shù)據(jù)并創(chuàng)建出對(duì)應(yīng)的圖表后

數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析具體操作如下


選擇「Analyze」,根據(jù)研究需求選擇對(duì)應(yīng)的分析方法進(jìn)行分析。


Step 2:

選擇「Draw」選擇相應(yīng)的標(biāo)記方法。


Step 3:

選擇「文本標(biāo)記圖標(biāo)」進(jìn)行統(tǒng)計(jì)結(jié)果的標(biāo)記。根據(jù)發(fā)表需求可以標(biāo)記為:p < 0.05 或 * 。


二、圖表導(dǎo)出格式

GraphPad Prism 提供了多種圖表導(dǎo)出格式,用戶可以根據(jù)需求選擇適合的格式,以便在論文、報(bào)告或演示中使用。選擇「Export」可以根據(jù)研究需求選擇不同的導(dǎo)出格式。以下是常見的導(dǎo)出格式及其特點(diǎn):

1

圖像格式:


PNG:PNG 格式是一種無損壓縮圖像格式,支持透明背景,適合用于網(wǎng)頁展示和需要透明背景的場(chǎng)合。然而,PNG 格式的分辨率相對(duì)較小,可能不適合用于打印或出版高質(zhì)量圖像。

JPEG:JPEG 格式是一種壓縮圖像格式,適合用于網(wǎng)頁展示和快速傳輸。然而,由于 JPEG 格式是有損壓縮,因此在需要高質(zhì)量輸出的場(chǎng)合(如打印或出版)可能不太適合。

TIFF:TIFF 格式是一種位圖格式,適合用于高質(zhì)量的圖像輸出。期刊通常要求 1,200 點(diǎn)/英寸(dpi)的 TIFF 文件,以確保圖像的清晰度。此外,TIFF 格式還支持選擇透明背景,方便與其他圖像或文本進(jìn)行組合。

BMP:無損格式,文件體積較大,適合需要高質(zhì)量圖像的場(chǎng)景。

2

矢量格式:


PDF:矢量格式,PDF 文件對(duì)矢量和字體進(jìn)行編碼,因此生成的文件可以拉伸至任何尺寸而不會(huì)降低質(zhì)量。PDF 格式是在 Mac 程序之間傳輸圖像的首選,同時(shí)也適合用于打印和出版。

EPS:矢量格式,是一種矢量圖像格式,與 PDF 類似,支持無限分辨率和透明背景。EPS 格式常用于出版和打印高質(zhì)量圖像,適合用于專業(yè)排版軟件(如 Adobe Illustrator)。

SVG:矢量格式,適合用于網(wǎng)頁或交互式圖表。


選擇「Send」,可以將多個(gè)圖表內(nèi)容導(dǎo)出為一個(gè) PDF 文件;也可以導(dǎo)出為 PowerPoint 幻燈片。

PDF文件:將多個(gè)圖表合并為一個(gè) PDF 文件,方便整體導(dǎo)出。

PowerPoint:將圖表直接導(dǎo)出為 PowerPoint 幻燈片,方便在演示中使用。



選擇「File」「Save」后,可以保存為 .pzfx 格式。

Prism 項(xiàng)目文件:保存為 .pzfx 格式,方便后續(xù)編輯和修改。


總結(jié)

如何在 GraphPad Prism 中,應(yīng)用不同的高級(jí)統(tǒng)計(jì)模型。

題圖來源:圖蟲創(chuàng)意

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