撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
當(dāng)前的病原體監(jiān)測(cè)體系聚焦家畜(豬、牛、羊等養(yǎng)殖動(dòng)物)與伴侶動(dòng)物(貓、狗等寵物),但非傳統(tǒng)養(yǎng)殖(皮毛動(dòng)物、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物等)和野生哺乳動(dòng)物的病原交互未受重視。
2025 年 8 月 26 日,復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院粟碩團(tuán)隊(duì)(Yuqi Shi、Yuxing Li等人為共同第一作者)在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊Cell上發(fā)表了題為:Extensive cross-species transmission of pathogens and antibiotic resistance genes in mammals neglected by public health surveillance 的研究論文。
該研究在看似健康的無癥狀哺乳動(dòng)物(含養(yǎng)殖與野生哺乳動(dòng)物)中檢測(cè)到大量未被記錄的病毒和細(xì)菌,并揭示了其中廣泛的跨物種傳播,還在養(yǎng)殖和野生哺乳動(dòng)物的微生物組中發(fā)現(xiàn)了多種與人類共享的可移動(dòng)的抗生素抗性基因。這些發(fā)現(xiàn)凸顯了公共衛(wèi)生監(jiān)測(cè)中忽視了哺乳動(dòng)物中病原體和抗生素抗性基因的廣泛跨物種傳播。
在這項(xiàng)最新研究中,研究團(tuán)隊(duì)通過對(duì) 973 只無癥狀哺乳動(dòng)物的糞便和組織樣本進(jìn)行宏基因組和宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,從中鑒定出128 種病毒(其中 30 種為新發(fā)現(xiàn)病毒),包括一個(gè)新的冠狀病毒屬;10255 種細(xì)菌(超過 7000 種未被描述過),201 種真菌和7 種寄生蟲。
養(yǎng)殖和野生哺乳動(dòng)物共存有 13.3% 的病毒種類,其中包括在亞洲黑熊體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的犬冠狀病毒(canine coronavirus)以及在兔子體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的蓋塔病毒(Getah virus),而 H5N1 禽流感病毒的 2.3.4.4b 分支則在一只野生豹貓?bào)w內(nèi)被發(fā)現(xiàn)。該研究還發(fā)現(xiàn),養(yǎng)殖哺乳動(dòng)物與野生哺乳動(dòng)物之間存在潛在的細(xì)菌病原體傳播,還發(fā)現(xiàn)了與人類體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌菌株具有高度遺傳相似性的菌株。
研究團(tuán)隊(duì)還在養(yǎng)殖和野生哺乳動(dòng)物的微生物組中觀察到 157 種臨床重點(diǎn)關(guān)注的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARG),其與人類微生物組中的 ARG 的同源性超過 99%,且常常與可移動(dòng)遺傳元件(MGE)共同出現(xiàn)。
該研究的核心發(fā)現(xiàn):
在 973 種非傳統(tǒng)哺乳動(dòng)物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了 7063 種未描述過的細(xì)菌和一個(gè)新的冠狀病毒屬;
在 4 種不同的哺乳動(dòng)物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了高度多樣化的甲型流感病毒;
細(xì)菌,包括病原體,在不同地區(qū)、宿主類別和生活方式之間都有共享;
養(yǎng)殖和野生哺乳動(dòng)物與人類共享的可移動(dòng)的抗生素抗性基因。
總的來說,提示了無癥狀動(dòng)物可能成為新型人畜共患病病毒的潛在宿主,暗示了動(dòng)物微生物組可能是人類抗生素抗性基因的天然儲(chǔ)庫,抗生素濫用可能加速其跨物種傳播,凸顯了病原體與抗生素抗性基因在“動(dòng)物-環(huán)境-人類”界面的流動(dòng)需系統(tǒng)性監(jiān)測(cè)。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00971-7
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