撰文丨王聰

編輯丨王多魚

排版丨水成文

癌癥的發(fā)展是一個多步驟的過程，在此過程中癌細胞獲得了克服復制潛能限制以及逃避免疫系統(tǒng)破壞的能力。與此同時，非癌細胞（比如基質(zhì)細胞）逐漸被重新編程以支持腫瘤生長。

腫瘤發(fā)生的器官因其獨特的組織駐留細胞類型，造就了腫瘤微環(huán)境（TME）的顯著差異，并塑造了腫瘤不同的臨床特性，例如分子亞型、侵襲能力和對靶向治療或免疫治療的反應。單細胞 RNA 測序（scRNA-seq）和空間轉(zhuǎn)錄組學（ST）的最新進展已成為探索腫瘤微環(huán)境多樣性的強大工具。然而，表型相關(guān)的細胞類型是否普遍存在于不同癌癥類型和階段中仍不清楚。此外，構(gòu)成腫瘤微環(huán)境內(nèi)特定生態(tài)型的不同細胞類型之間的相互作用尚不明確。

因此，從泛癌角度探究腫瘤微環(huán)境成分的動態(tài)變化以及細胞間相互作用，對于闡明癌癥的發(fā)病機制至關(guān)重要，并且是一個很有前景的治療靶點。

2025 年 8 月 25 日，同濟大學生命科學與技術(shù)學院王晨飛教授、吳秋助理教授作為共同通訊作者（博士后韓雅為第一作者）在 Nature 子刊NatureCancer上發(fā)表了題為：Spatiotemporal analyses of the pan-cancer single-cell landscape reveal widespread profibrotic-associated ecotypes regulating tumor immunity 的研究論文。

該研究集成了來自公共數(shù)據(jù)集中的 36 種癌癥類型，746 個樣本的超過 400 萬個單細胞的數(shù)據(jù)；以及 6 種癌癥類型 62 個樣本的空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)。涵蓋癌旁正常組織、癌前病變組織、腫瘤組織和轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本，建立了系統(tǒng)描繪腫瘤微環(huán)境異質(zhì)性的泛癌圖譜——TabulaTIME（http://wanglab-compbio.cn/TabulaTIME/）。研究團隊對泛癌尺度腫瘤微環(huán)境內(nèi)多個細胞譜系進行了詳細注釋，將其分為殺傷型淋巴細胞、調(diào)控型淋巴細胞、B 淋巴細胞、髓系細胞、成纖維細胞及內(nèi)皮細胞六大主要的細胞譜系，探討了這些細胞亞型與預后的關(guān)系，識別出在腫瘤發(fā)生和進展過程中起重要作用的細胞亞型，并對腫瘤特異的細胞類型和多細胞互作進行了深度分析。

腫瘤微環(huán)境（TME）在腫瘤發(fā)展過程中不斷演變，并影響微環(huán)境中的細胞，從而為腫瘤生長營造有利環(huán)境。

在這項最新研究中，研究團隊收集了迄今為止規(guī)模最大的已發(fā)表的實體瘤相關(guān)單細胞 RNA 測序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)集，包含約 400 萬個細胞。利用這一龐大的數(shù)據(jù)集，研究團隊構(gòu)建了涵蓋 36 種不同癌癥類型的腫瘤微環(huán)境（TME）細胞的綜合圖譜——TabulaTIME。定義了腫瘤微環(huán)境中的六大主要細胞譜系和 56 種細胞亞型。由此產(chǎn)生的腫瘤微環(huán)境的全面藍圖，為理解腫瘤微環(huán)境的復雜性、識別與表型相關(guān)的細胞類型以及開發(fā)可能適用于多種癌癥類型的創(chuàng)新治療策略提供了寶貴的路線圖。

進一步綜合分析表明，CTHRC1 是細胞外基質(zhì)相關(guān)的癌癥相關(guān)成纖維細胞（CAF）的標志物，這些細胞在不同癌癥類型中富集。時空分析進一步表明，CTHRC1+CAF 位于惡性區(qū)域和正常區(qū)域之間的前沿，可能阻止免疫細胞浸潤。此外，該研究還發(fā)現(xiàn)，

SLPI

CTHRC1

總的來說，這項研究建立了異質(zhì)性腫瘤微環(huán)境的全面單細胞圖譜，并為癌癥治療中靶向促纖維化生態(tài)型提供了潛在的治療策略。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s43018-025-01039-5